Prirodno-matematički fakultet sarađuje sa velikim brojem javnih ustanova, udruženja građana i nevladinih organizacija iz domena obrazovanja, ekologije, zaštite životne sredine, turizma, prostornog planiranja i drugih oblasti povezanih sa prirodnim naukama i matematikom. U narednom periodu, naš Fakultet planira da ojača i proširi saradnju i sa drugim ustanovama koje su zainteresovane za realizaciju zajedničkih aktivnosti. U nastavku su navedene institucije sa kojima Fakultet ima ostvarenu saradnju.
Obrazovne institucije:
- JU Gimnazija Banja Luka
- JU OŠ Branko Radičević, Banja Luka
- JU OŠ Zmaj Jova Jovanović, Banja Luka
- JU OŠ Borisav Stanković, Banja Luka
Javne ustanove:
- JU Turistička organizacija Republike Srpske
- Uprava za indirektno oporezivanje Bosne i Hercegovine
- Republički zavod za zaštitu kulturno-istorijskog i prirodnog nasljeđa, Banja Luka
- Republički hidrometorološki zavod, Banja Luka
- JZU Institut za javno zdravstvo Republike Srpske, Banja Luka
- JU Veterinarski zavod Republike Srpske „Dr Vaso Butozan“, Banja Luka
- JU Institut za urbanizam, građevinarstvo i ekologiju Republike Srpske
- JU Muzej Republike Srpske
- Republički pedagoški zavod Republike Srpske
- Republički zavod za statistiku
- Republička uprava za geodetske i imovinsko-pravne poslove
- Fond za zaštitu životne sredine i energetsku efikasnost Republike Srpske
Društva i organizacije:
- Društvo matematičara Grada Banja Luka
- Društvo Prostornih planera u Republici Srpskoj
- Centar za demografska istraživanja
- Sportsko ribolovno društvo Banja Luka
- Internacionalni Medicinski centar – Centar za radioterapiju, Banja Luka
- Centar za životnu sredinu, Banja Luka
- Save the Children, Sjeverozapadni Balkan
- Centar za životnu sredinu i uređenje prostora, Banja Luka
- Centar za klimatska istraživanja, Banja Luka